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基因表达研究揭示了非洲沙门氏菌的新亮点

文章作者:www.cs-vaccine.com发布时间:2019-12-30浏览次数:600

利物浦大学的科学家向前迈进了一步,了解导致沙门氏菌严重流行的细菌,沙门氏菌目前每年在撒哈拉以南非洲造成大约40万人死亡。

发表在PLOS Biology期刊上并代表了五年的工作,综合生物学研究所的研究人员完成了迄今为止最大的细菌比较基因表达研究之一。

当通常引起胃肠疾病的沙门氏菌进入血液并通过身体传播时,就会发生侵袭性非伤寒性沙门氏菌病(iNTS)。非洲iNTS流行病是由抗生素抗性鼠伤寒沙门氏菌(ST313)变种引起的,该病毒通常影响免疫系统受疟疾或HIV损害的个体。

研究作者RocíoCanalsAlvarez博士解释说:“尽管非洲和世界上鼠伤寒沙门氏菌的基因组有95%相同,但剩下的5%是非常不同的。”“这些差异中的大多数不会引起基因表达的变化,但我们需要识别影响基因表达的遗传变化,并可能影响人类细菌感染的结果。“

为了发现这些关键的遗传差异,研究人员在致命的非洲沙门氏菌和常见的“全球”胃肠炎版本之间进行了大规模的比较转录组学方法。

研究人员以16种不同的方式培训了每种沙门氏菌菌株,代表了人类感染过程的不同阶段。他们还从小鼠巨噬细胞中分离出沙门氏菌 - 细菌在感染期间用来劫持宿主的免疫细胞。

通过研究非洲和世界范围内鼠伤寒沙门氏菌在这些不同条件下的转录组,他们发现677个基因和小RNA在两种菌株之间表达不同。

平行蛋白质组学方法鉴定了导致蛋白质水平改变的基因表达差异。两个棱镜验证实验揭示了非洲沙门氏菌发育不良的遗传基础,并发现了一种新的细菌质粒维持系统。

为了使世界各地的研究人员能够使用新信息,新数据以用户友好的在线工具(SalComD基因表达谱)呈现。

“这项研究将转录组学的力量提升到新的细菌水平。我们的“功能转录组”方法与广大受众相关,可应用于许多其他生物。分析管道和社区数据资源是常见的,可以激发其他人使用类似的方法来回答他们的研究问题,“负责这项研究的Jay Hinton教授补充说。