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全球微生物组大数据搜索引擎上线

文章作者:www.cs-vaccine.com发布时间:2020-02-02浏览次数:1082

近日,中国科学院青岛生物能源与过程研究所单细胞研究中心正式发布了第一个微生物组大数据搜索引擎 MSE(Microbiome Search Engine;以整个微生物组为基础进行智能搜索和大数据挖掘)分析单位成为现实。

微生物组,也被称为“细菌组”。人类微生物组也被称为每个人的“第二基因组”。 “第二基因组”可由数百万个微生物基因组成,其数量是人类基因组的数万倍。根据人类积累的大量微生物数据,寻找具有相似“结构”或“功能”的细菌样本,以实现对未知功能菌群的解释和挖掘,以及对数据空间的整体思考。整个已知的微生物组,它一直是微生物组行业的关键瓶颈之一。大量微生物学“大数据”的搜索,挖掘和机器学习可以帮助人们了解微生物群体与相关疾病之间的关系,从而利用人体各部位的共生菌群实现个性化的精准健康,精确护理和精确。营养。

MSE通过建立超高速比对算法和微生物群落的数字索引机制,根据植物结构或大量样本的功能相似性列出“目录”。当输入未知样本时,引擎可以基于该“目录”快速并自动从大量微生物大数据海洋中选择与样本最相似的匹配,其中包含植物相似性的信息。

单细胞研究中心与搜索引擎一起发布了分析软件Parallel-META 3,该软件可以分析大量未知的微生物组样本进行结构和功能分析,并可以与其数据库搜索匹配结果进行更深入的比较分析。