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“大数据+基因测序”助推肿瘤靶向药物研发

文章作者:www.cs-vaccine.com发布时间:2019-12-18浏览次数:659

基因测序可为肿瘤的早期筛查,早期诊断和药物开发提供重要依据,为肿瘤精准医学的实施奠定基础。近日,“百度 - 协和医学院食管癌研究项目”在北京协和医学院举行了签约仪式。双方将充分发挥北京协和医学院的医学研究优势和百度大数据与人工智能的技术优势,发现它们与中国人息息相关。早期诊断食管癌的相关标志物为食管癌的早期筛查和诊断提供了科学依据,为食管癌靶向药物的开发提供了依据。

生物标志物和目标研究迫在眉睫

据估计,全世界超过50%的食管癌患者在中国。由于缺乏早期诊断标志,大多数患者被发现是先进的,而且缺乏有效的临床治疗药物,患者的5年生存率仅为10%左右。

分子肿瘤学国家重点实验室研究员,博士生导师刘志华说:“目前,欧洲和美国的食管癌研究对中国的医学界没有太大的参考价值。因此,测序和对食管癌全基因组进行了功能研究,以找出食管癌早期诊断的生物标志物和药物靶点。“

中国工程院院士,分子肿瘤学国家重点实验室主任詹启民说:“由于缺乏早期诊断标志物,中国食管癌的临床治疗效果不佳。事实上,进步当今的技术已经使许多癌症已经可用。更有效的药物控制,但食道癌在靶向药物治疗中几乎是空白。“

据了解,分子靶向治疗通过作用于肿瘤细胞的特定靶标而在多种肿瘤中显示出良好的功效。在食管癌的治疗中,一些药物已经临床探索和应用。实际上,EGFR,HER2 +和其他途径的靶向药物的大多数II期和III期临床研究都令人失望。此外,一些新的靶向药物的结果值得期待。目前,大多数与食管癌相关的靶向研究来自西方人群的食管腺癌或食管胃癌。国内数据相对稀少。预计尼妥珠单抗在中国的临床研究将带来令人振奋的结果。

需要深入探索互联网以改变医疗保健

事实上,中国对食管癌基因测序和基因突变的研究已经悄然进行。近年来,由詹启民领导的中国医学科学院肿瘤医院分子肿瘤学国家重点实验室研究团队与华大基因和汕头大学医学院的研究人员合作,对高通量测序进行了分析。和比较基因组杂交芯片。学习功能和临床验证研究系统地揭示了食管鳞状细胞癌的基因突变背景,并发现了与食管鳞状细胞癌的发展和临床预后相关的基因。

根据詹启民的研究,潜在治疗靶点的分析显示,PI3K是食管鳞状细胞癌突变频率最高的潜在药物靶点,并发现了潜在的新药靶点,如PSMD2,RARRES1,SRC,GSK3β和SGK3。据悉,2014年5月1日,《自然》杂志正式公布了上述重大科技成果。

据了解,“百度 - 协和医学院食管癌研究项目”由北京协和医学院分子肿瘤学国家重点实验室实施。根据计划,合作项目将于2016年初开始,完成1500例食管癌患者组织样本的采集,两年内收集100个食管癌家系的血样,完成整个项目的测序和生物分析。 2017.工作。

詹启民认为,最有效的癌症预防和治疗措施是早期筛查和早期诊断。协和与百度合作,目前1500个样本分析的数据量是世界上最大的。

此外,食管癌的医学研究需要在全基因组测序和比较过程中获得大量数据。这些数据的存储,生物分析和临床相关性分析需要巨大的数据存储和计算能力。

“基因测序产生的数据需要大量的存储空间,测序后的处理和分析需要强大的计算资源。这些功能是百度擅长的。此外,百度在分布式计算方法和算法方面有着深刻的积累。百度研究院副院长张伟表示,这将有助于测序结果对比分析的效率和有效性。

在中国大力推广精准医学的背景下,“互联网+医疗”已成为一种熟悉的组合。对此,张伟认为:“目前,很多'互联网+医疗'的做法和尝试,水平相对较浅。例如,现在更加实践的注册平台,角色是连接人和医院,但注册资源本身是有限的,最后是数字给谁,你需要更聪明。“

“至于如何利用互联网技术改变医疗保健,如精准医疗,个性化医疗,甚至未来的智能诊断,智能医疗,这些仍处于起步阶段。”张伟进一步说。