交流合作

您所在位置:首页 > 交流合作 > 正文

复旦大学疾病研究精准医学知识库构建项目启动

文章作者:www.cs-vaccine.com发布时间:2020-02-13浏览次数:1726

10月10日,记者从复旦大学获悉,国家重点研发计划“精准医学研究”的重点项目“疾病研究精确医学知识库建设”在校正模式下启动。据悉,该国家重点研发计划将力争在5年后建立具有标准规格,综合信息,开放共享,用户友好和动态更新的精确医学知识库。该项目将形成三大成就:“精准医学本体论和语义表征标准”,“精确医学知识库”和“精准医学知识库管理与共享平台”。它完全支持精准医学的基础研究和临床应用,填补了国内精准医学知识库。场空白。

据报道,该项目由复旦大学生物医学科学研究所教授刘磊负责。它汇集了包括复旦大学,中国军事医学科学院,中国医学科学院,中国科学院和上海生物信息中心在内的长期医学知识库建设和生物医学。信息公共服务的主力军。

精准医学是基于大样本研究中疾病分子机制的知识体系,基于生物医学数据,特别是生命组数据,基于个体患者在基因型,表型,环境和生活方式上的特异性。应用现代遗传学,分子影像学,生物信息学和临床医学,开发个性化的精确预防,准确诊断和精确治疗。因此,精准医学将产生大量数据,精准医学的应用也将依赖于对数据和信息的深入而准确的分析。

帮助研究人员从海量信息中高效准确地找到相关知识,帮助临床医生准确确定疾病类型,并通过诊断结果找到最佳治疗方案。这样的知识库系统是该项目的研发目标,也是精准医学。关键环节。精准医学知识库建成后,将为科研和临床诊断提供多层次的精准医学知识服务,帮助识别潜在的生物标志物和药物目标,促进中国医药行业的创新。同时,节省购买商业软件和改善国家。投资基金,降低中国精准药物使用和临床应用研究的成本,具有巨大的潜在经济和社会价值。

知识库系统针对的是大量准确的医疗信息,数据类型复杂,资源分布不均,利用率低,标准不一致的问题。它面向整个疾病谱,并在标准语义网络下整合生物医学本体和多类型文本。资源,整合多层次生物信息数据,利用先进的知识发现技术,构建统一,规范,制度化,开放,共享,高效,准确,自动更新的精准医学知识库。基于生物医学语义学和本体论,可以在精准医学大数据平台上实现全文检索,文本识别,关键词分析等功能。它集成了大规模的文档集成分析和知识发现,并提供定制的医学研究知识。图书馆系统和知识推送系统。

据报道,包括美国NCBI和欧洲EBI在内的国际大型生物信息中心目前正在建设生物医学知识库。一些大型信息技术公司也开发了生物医学知识库,如8月正式登陆中国的Watson肿瘤治疗和临床应用系统。外国公司还开发了GeneGo,IPA和Pathway Studio等专业平台,通过自然语言处理技术从文档中提取信息和知识。它们为生物医学研究和药物开发提供了有效和广泛的解决方案,涵盖从药物发现到新药申请到临床试验的所有方面。但是,这些商业软件的核心数据是保密的,需要购买和使用。更重要的是,这些外国组织开发的知识库与中国人口的独特疾病谱和遗传背景不相容。

“目前,国内医学知识库的建设刚刚起步,主要基于单一信息源的医学知识库,以及一些具有独立建设和结构的专业知识库。这些知识库也需要进行在完整的数据和标准共享方面。完美,符合国际标准。“刘磊说,为了更好地支持中国的精准医学,建立一个具有中国疾病特征的自主开发的精准医学知识库势在必行。