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Nat Meth:如何让基因表达分析更快更便宜

文章作者:www.cs-vaccine.com发布时间:2019-09-25浏览次数:1024

最近,耶鲁大学的一个研究小组开发了一种简单的方法,可以显着减少大规模基因表达分析的时间和成本。相关研究结果于3月2日在Nature的出版物《自然方法》(自然方法)上发表。

在耶鲁大学医学院放射治疗助理教授Abhijit Patel的带领下,研究小组创造了一种工具,该工具采用新一代高通量DNA测序技术,可以更容易地同时测量大量细胞或组织。基因活动。 DNA被认为是生命的蓝图。了解哪些基因在不同条件下被激活或关闭是我们理解生物学和疾病的基础。进一步阅读:Nature的出版物:新的计算方法大大加速了基因表达的估计。

这种称为模块化早期标记扩增(META)RNA的方法允许在许多样品中同时定量各种微小RNA或mRNA,并且需要比现有数字分析技术更少的测序深度。该方法允许在逆转录期间分配定量标签以在竞争性扩增和深度测序之前混合预样品。这种简单,可扩展且廉价的方法增加了大规模基因表达研究的效用。

基因表达分析通常用于临床试验。例如,在乳腺癌患者中,通常通过检测肿瘤样本中的基因表达来预测复发的可能性,以确定化学疗法是否有益。根据Patel的说法,另一种高通量方法可用于同时测量许多患者肿瘤中的基因表达。最后,这种方法可以降低这种检测的成本并使其更广泛地可用。

本文的高级作者帕特尔说:“为了得出关于复杂基因表达模式的有意义的结论,通常需要对大量临床或实验样本进行统计分析。我们相信这项新技术将有助于我们很兴奋,因为这种方法使得大规模RNA分析对大多数研究人员和临床实验室来说更加实用和容易。“

该研究由耶鲁癌症中心,尊敬的Tina Brozman基金会以及国家和高级科学转化中心的临床和转化科学奖资助。