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CSHL科学家创建了遗传 常见嫌疑人的排名列表

文章作者:www.cs-vaccine.com发布时间:2019-11-21浏览次数:2000

是什么让我们的基因成为我们.我们不是秘密!但基因通常是导致衰弱性疾病的基础。了解任何疾病的主要线索之一是看到哪些基因在疾病发作期间表现异常。然而,通常不清楚异常遗传活动是否是手头疾病所特有的,或仅仅是不健康身体的一般症状。冷泉港实验室(CSHL)的科学家现已开发出一系列常见嫌疑人,这些嫌疑人可能对研究人员和临床医生而言非常宝贵。

“想象一个通灵者,”CSHL计算生物学家Jesse Gillis介绍道。 “当他们为观众做'冷读'时,他们会说'某人在这里有戴夫或大卫的名字等等,对吗?他们很可能猜到了。”

那一刻,观众没有考虑大卫这个名字的受欢迎程度,这让旁观者戴夫惊艳不已。

Gillis和博士后研究员Maggie Crow指出,这项方法的陷阱在一项研究中可能存在问题,该研究比较了健康细胞的遗传活性与疾病相关细胞的遗传活性 - 一项名为“差异”的研究。

他们认为,如果有人预测在发现差异表达的过程中会识别哪个基因,那么该基因似乎与疾病有关,但仅仅因为它与几乎所有疾病相关。

与不列颠哥伦比亚大学的Paul Pavlidis一起,两人对大约27,000个样本进行了635个数据集的计算。他们发现像Dave这样的基因:它们可能会受到任何疾病的影响,这些疾病的出现并不令人惊讶。发现这种效应使团队能够识别特定条件特有的基因。

在PNAS期刊中详述的结果“应该不会让人大吃一惊,但准确量化它们是有价值的,”吉利斯说。 “玛吉在这项工作中的天才正在悄然走下坡路,并说生物过程可以推动这种变化。”

Crow指出驱动炎症的基因作为这些生物过程的一个例子。这些基因在癌症患者中非常活跃,但在其他疾病中也是如此,例如阿尔茨海默病。这些信息嵌入在Gillis和Crow列表中,并提供了解释这些基因的背景信息。

“我们有一个排名列表,我们正在努力使其易于使用和构建,”Crow补充道。希望新数据能够帮助研究人员设计更好的实验,发现新的药物靶点,并开发各种疾病的治疗方法。