专家园地

您所在位置:首页 > 专家园地 > 正文

猛犸象为何灭绝基因组提供新线索

文章作者:www.cs-vaccine.com发布时间:2020-02-02浏览次数:1288

也许你还记得电影中的两个可爱的猛犸象《冰河世纪》,但事实上它们在公元前2000年已经灭绝了。科学家正在寻找猛犸象从剩余骨骼中消失的线索。最近,一个国际研究小组在《Current Biology》杂志上发表了他们的研究成果。

研究小组由瑞典自然历史博物馆的研究人员领导。他们测试了两只猛犸象的标本,其中一只来自西伯利亚,约年前,另一只来自弗兰格尔岛,大约4300年前,不久之后猛犸象灭绝了。

利用这两个新测序的猛犸象基因组,研究人员发现了遗传多样性的下降和与弗兰格尔岛近亲繁殖有关的序列的增加,但为什么猛犸象在几百年后死亡。一个谜。该文章的第一作者Eleftheria Palkopoulou说:“我们仍然无法确定灭绝的原因。”

考古研究表明,在更新世或晚更新世期间,猛犸象的数量是稳定的。然而,在年前的更新世末期和全新世的开始,几乎所有的这种动物都消失了,只剩下几个岛屿。弗兰格尔岛上的猛犸象代表了最后一批,持续了4000多年。

Palkopoulou及其同事对弗兰格尔岛上的一个猛犸龋样本进行了全基因组测序,这个样本大约有4300年的历史。他们处理样品以去除在古老的DNA降解期间通过胞嘧啶脱氨作用形成的尿嘧啶,使用Illumina的HiSeq 2500测序,并与非洲大草原的大象参考基因组进行比较。

加拿大合作者使用类似的方法对大约44,800年前来自西伯利亚Oimakang的猛犸象的软组织样本中的DNA进行测序。在晚更新世期间,一大群猛犸象居住在该地区。

对于弗兰克尔岛上的个体,超过四分之三的猛犸象读取大象基因组,平均覆盖深度为11.2倍。对于Oemiacan猛犸象序列,比较比率略低(约64%),平均覆盖深度为17倍。

线粒体基因组序列表明,猛犸象属于以前认为在100万年前有分枝的母系。然而,基于X染色体和常染色体染色体的序列,作者希望这个分支在大约5万年前更加接近。

研究人员尚未确定导致猛犸象人口显着减少的具体事件。 “我们不确定它是否与天气有关,”Palkopoulou说。没有人类狩猎。这是绝对的。所以有点令人费解的是他们突然遇到了瓶颈。

最后,基因组分析表明,弗兰格尔岛标本的遗传变异减少,其杂合序列比其他标本少约五分之一。这些和其他数据与弗兰克尔岛的种群数量减少一致,表明更频繁的近亲繁殖加速了灭绝。即便如此,Palkopoulou认为需要更多的研究来追踪下降轨迹。 “猛犸象在岛上生活了6000年,但在4000年前突然消失了,”她指出。

瑞典研究人员正在筛查其他弗兰格尔岛标本,希望找到最适合测序的基因组,以解决猛犸象灭绝的神秘面纱。